牛国清 博士，研究员，博士生导师
电子邮箱：niu062376@swu.edu.cn
长期致力于微生物资源挖掘利用与合成生物技术方面的研究，通过微生物学、分子生物学和天然产物化学等学科交叉，围绕微生物资源收集、代谢产物生物合成与调控、代谢工程改造和合成生物技术等四个方面开展了系统深入的研究工作。近年来，主持国家自然科学基金面上项目、国家重点研发计划“合成生物学”重点专项子课题、国家重点基础研究发展计划子课题和重庆市“科技创新领军人才支持计划”等科研项目10余项。近年来已在Trends in Biochemical Sciences、Trends in Biotechnology、FEMS Microbiology Reviews、Trends in Microbiology、Molecular Cell、Metabolic Engineering、Cell Chemical Biology、Journal of Biological Chemistry、ACS Synthetic Biology、Molecular Microbiology、Applied and Environmental Microbiology等SCI收录刊物发表论文30余篇。其中，T类成果4篇，A1类成果5篇，授权国家发明专利3项，部分成果获“川渝科技学术大会”优秀论文奖。2017年通过公海gh555000aa线路检测"聚贤工程"人才引进计划，受聘为生物技术中心研究员，同年遴选为“首批引进人才聘任高校巴渝学者特聘教授”，2018年入选重庆市第四批“高层次特殊人才支持计划”。
一、教育经历
2002年-2006年 中国科学院微生物研究所，遗传学，博士；
1999年-2002年 公海gh555000aa线路检测，生化与分子生物学，硕士；
1994年-1998年 公海gh555000aa线路检测，农学，学士。
二、工作经历
2023年6月-至今 研究员 公海gh555000aa线路检测，研究方向为微生物天然产物生物合成与合成生物学；
2017年4月-2023年5月 研究员 西南老员工物技术中心，研究方向为微生物天然产物生物合成与合成生物学；
2016年9月-2017年3月 项目研究员 中国科学院微生物研究所，微生物资源前期开发国家重点实验室，研究方向为微生物次级代谢产物的生物合成与调控；
2010年6月-2016年8月 副研究员 中国科学院微生物研究所，微生物资源前期开发国家重点实验室，研究方向为微生物次级代谢产物的生物合成与调控；
2006年11月-2010年4月 博士后 美国俄克拉荷马大学健康科学中心，微生物学与免疫学系，研究方向为生物膜中变形链球菌的遗传与生化研究。
三、主持科研项目
1. 国家自然科学基金面上项目“核苷肽类抗生素阿波霉素的生物合成研究”，2019年-2022年，主持；
2. 国家重点研发计划“合成生物学”重点专项 “高值化合物生物合成体系的智能组装及高效运行”，2020年-2025年，子课题主持；
3. 国家自然科学基金面上项目“核苷肽类抗生素缩合机制的研究”，2015年-2018年，主持；
4. 国家自然科学基金面上项目“谷氏菌素生物合成重要调控基因－gouR作用的分子机制”，2012年-2015年，主持；
5. 重庆市“科技创新领军人才支持计划”项目，2019年-2021年，主持；
6. 公海gh555000aa线路检测“聚贤工程”启动项目，2017年-2022年，主持；
7. 重庆市基础科学与前沿技术研究一般项目，2018年-2020年，主持；
8. 重庆市自然科学基金，2019年-2021年，主持;
9. 中央高校基本业务费专项资金，2018-2019年，主持。
四、发表论文 （以发表时间排序）
1. Li Z, He L, Wang X, Huo Q, Zheng G, Kong D, Lu Y, Xia H, Niu G*. (2023) Elucidation of the ferrichrome siderophore biosynthetic pathway in albomycin-producing Streptomyces sp. ATCC 700974. Journal of Biological Chemistry 299(4):104573.
2. Li X#, Niu G#, Fan Y, Liu W, Wu Q, Yu C, Wang J, Xiao Y, Hou L, Jin D, Chen S, Hu R, Yang Y, Pei Y*. (2023) Synthetic dual hormone-responsive promoters enable engineering plants with broad-spectrum resistance. Plant Communications (In press) doi: 10.1016/j.xplc.2023.100596.
3. Liu M, Wang K, Wei J, Liu N, Niu G, Tan H, Huang Y*. (2023) Comparative and functional analyses reveal conserved and variable regulatory systems that control lasalocid biosynthesis in different Streptomyces species. Microbiology Spectrum 11(2):e0385222.
4. Wang M, Zhang Y, Lv L, Kong D, Niu G*. (2022) Biosynthesis and chemical synthesis of albomycin nucleoside antibiotics. Antibiotics 11: 438.
5. 邹莹，吴嘉炳，张雨欣，李殿怡，牛国清*，司军*。（2022）茎瘤芥根际一株产紫色杆菌素杜擀氏菌的分离鉴定及其基因组分析。微生物学报。62: 4122–4140.
6. Li Z, Huang P, Wang M, Wang X, Wang L, Kong D, Niu G*. (2021) Stepwise increase of thaxtomins production in Streptomyces albidoflavus J1074 through combinatorial metabolic engineering. Metabolic Engineering 68:187-198
7. Wang X, Fu Y, Wang M, Niu G*. (2021) Synthetic cellobiose-inducible regulatory systems allow tight and dynamic controls of gene expression in Streptomyces. ACS Synthetic Biology 10(8):1956-1965.
8. Liu N, Guan H, Niu G, Jiang L, Li Y, Zhang J, Li J, Tan H*.(2021) Molecular mechanism of mureidomycin biosynthesis activated by introduction of an exogenous regulatory gene ssaA into Streptomyces roseosporus. Science China Life Sciences doi: 10.1007/s11427-020-1892-3.
9. Wang L, Wang M, Fu Y, Huang P, Kong D, Niu G*. (2020) Engineered biosynthesis of thaxtomin phytotoxins. Critical Reviews in Biotechnology 40(8):1163-1171.
10. Niu G*, Li W*. (2019) Next-generation drug discovery to combat antimicrobial resistance. Trends in Biochemical Sciences 44(11):961-972.
11. Kong D, Wang X, Nie J, Niu G*.(2019) Regulation of antibiotic production by signaling molecules in Streptomyces. Frontiers in Microbiology 10:2927.
12. Niu G, Li Z, Huang P, Tan H*. (2019) Engineering nucleoside antibiotics toward the development of novel antimicrobial agents. Journal of Antibiotics 72(12):906-912.
13. Niu G*. (2018) Genomics-driven natural product discovery in actinomycetes. Trends in Biotechnology 36(3):238-241.
14. Li J, Li Y, Niu G, Guo H, Qiu Y, Lin Z, Liu W* and Tan H*. (2018) NosP-regulated nosiheptide production responds to both peptidyl and small-molecule ligands derived from the precursor peptide. Cell Chemical Biology 25(2):143-153.
15. Wei J, He L, Niu G*. (2018) Regulation of antibiotic biosynthesis in actinomycetes: Perspectives and challenges. Synthetic and Systems Biotechnology 3(4):229-235.
16. Niu G, Zheng J, Tan H*. (2017) Biosynthesis and combinatorial biosynthesis of antifungal nucleoside antibiotics. Science China Life Sciences 60(9):939-947.
17. Niu G, Chater KF, Tian Y, Zhang J and Tan H*. (2016) Specialised metabolites regulating antibiotic biosynthesis in Streptomyces spp. FEMS Microbiology Reviews 40(4):554-573.
18. 韦俊宏，张集慧，江玲娟，谭华荣，牛国清*。（2016）谷氏菌素生物合成基因gouC和gouD的功能研究。微生物学报。56: 406-417.
19. Niu G, Tan H*. (2015) Nucleoside antibiotics: biosynthesis, regulation and biotechnology. Trends in Microbiology 23(2): 110-119.
20. Liu N, Niu G, Xie Z, Chen Z, Itzek A, Kreth J, Gillaspy A, Zeng L, Burne R, Qi F, Merritt J*. (2015) The Streptococcus mutans irvA gene encodes a trans-acting riboregulatory mRNA. Molecular Cell 57(1):179-190.
21. Jiang L#, Wang L#, Zhang J, Liu H, Hong B, Tan H*, Niu G*. (2015) Identification of novel mureidomycin analogues via rational activation of a cryptic gene cluster in Streptomyces roseosporus NRRL 15998. Scientific Reports 5:14111.
22. Du D#, Wang L#, Tian Y, Liu H, Tan H*, Niu G*. (2015) Genome engineering and direct cloning of antibiotic gene clusters via phage fBT1 integrase-mediated site-specific recombination in Streptomyces. Scientific Reports 5:8740.
23. 王璐，杜德尧，李金娥，田宇清，刘浩* ，牛国清* ，谭华荣。（2015）尼可霉素生物合成基因簇的改造及其异源表达。微生物学报。55 :707-718.
24. Zou Z, Du D, Zhang Y, Zhang J, Niu G*, Tan H*. (2014) A γ-butyrolactone-sensing activator/repressor, JadR3, controls a regulatory mini-network for jadomycin biosynthesis. Molecular Microbiology 94(3):490-505.
25. Wei J, Tian Y, Niu G*, and Tan H*. (2014) GouR, a TetR-family transcriptional regulator, coordinates the biosynthesis and export of gougerotin in Streptomyces graminearus. Applied and Environmental Microbiology 80(2): 714-722.
26. Feng C, Ling H, Du D, Zhang J, Niu G*, Tan H*. (2014) Novel nikkomycin analogues generated by mutasynthesis in Streptomyces ansochromogenes. Microbial Cell Factories 13(1): 59.
27. Niu G#, Li L#, Wei J, Tan H*. (2013) Cloning, heterologous expression, and characterization of the gene cluster required for gougerotin biosynthesis. Cell Chemical Biology 20(1): 34-44.
28. Liu G, Chater KF, Chandra G, Niu G, Tan H*. (2013) Molecular regulation of antibiotic biosynthesis in Streptomyces. Microbiology and Molecular Biology Reviews 77(1): 112-143.
29. Du D, Zhu Y, Wei J, Tian Y, Niu G*, Tan H*. (2013) Improvement of gougerotin and nikkomycin production by engineering their biosynthetic gene clusters. Applied Microbiology and Biotechnology 97(14): 6383-6396.
30. Jiang L, Wei J, Li L, Niu G*, Tan H*. (2013) Combined gene cluster engineering and precursor feeding to improve gougerotin production in Streptomyces graminearus. Applied Microbiology and Biotechnology 97(24): 10469–10477.
31. Niu G, Tan H*. (2013) Biosynthesis and regulation of secondary metabolites in microorganisms. Science China Life Sciences 56(7): 581-583.
五、指导本科生情况
1. 校级老员工创新创业训练计划(X201910635190)：阿波霉素生物合成基因abmA和abmB的功能研究，2019-2020年，苏茜薇(含弘学院神农班2016级)，毕业去向：浙江老员工命科学研究院；
2. 国家级老员工创新训练计划(201910635021)：天然除草剂Thaxtomin高产菌株的构建，2019-2020年，王琳琪（含弘学院神农班2017级），毕业去向：复旦老员工命科学学院；
3. 国家级老员工创新创业训练计划(202010635082)：疮痂链霉菌中冠菌素 CFA-L-Ile 的致病机制研究，2020-2021年，钟佳洁（含弘学院神农班2018级），毕业去向：中国科学院微生物研究所；
4. 校级老员工创新创业训练计划(X202210635541)：茎瘤芥根际及内生微生物的分离筛选和鉴定，2022-2023年，韩熠然(园艺园林学院2019级)，毕业去向：中国科学院微生物研究所。
六、学术兼职
1. 《微生物学报》编委
2. 中国微生物学会编辑出版工作委员会委员
3. 微生物感染与转化专业委员会委员
4. 《Frontiers in Microbiology》副主编(Associate Editor)
七、招收专业
1. 博士后：生物学、合成生物学
2. 博士研究生：微生物学、生化与分子生物学
3. 硕士研究生：微生物学、生化与分子生物学